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Episode
- エピソード 1 : 完成！ニンジャガム！
- エピソード 2 : バートンとベレッカの長い一日
- エピソード 3 : 目覚めよ！少年バーン！
- エピソード 4 : 秘密の瞳のルーシー
- エピソード 5 : ニンジャダンサー・エマ
- エピソード 6 : WNAアカデミー!バトルスタート!
- エピソード 7 : シノビの里のカッペイ
- エピソード 8 : 決死の潜入!WNA本部!
- エピソード 9 : エマとルーシー 小さな冒険
- エピソード 10 : 新たな仲間？ロンとジェーン
- エピソード 11 : 地獄のサバイバルミッション
- エピソード 12 : かくれんぼで未知との遭遇
- エピソード 13 : ニンジャ捕獲中
- エピソード 14 : バートンを尾行せよ
- エピソード 15 : その名はスペースニンジャ！
- エピソード 16 : シノビの務め
- エピソード 17 : ロンとジェーンの潜入ミッション
- エピソード 18 : 夕陽に向かって帰れ
- エピソード 19 : オランジイのなく海
- エピソード 20 : 逃亡者レナード
- エピソード 21 : オエド温泉物語
- エピソード 22 : バートンとチョコミン
- エピソード 23 : イーグルシティ夏の陣
- エピソード 24 : カゲとの戦い
- エピソード 25 : オエドニンジャ大作戦！前編
- エピソード 26 : オエドニンジャ大作戦！後編
- エピソード 27 : 開催！ニンジャラCS
- エピソード 28 : バートンVSベレッカ！
- エピソード 29 : 美食ニンジャ・キース見参
- エピソード 30 : ダンとタイラー
- エピソード 31 : 行けカッペイ！新巻鮭！
- エピソード 32 : バーン！燃やせニンジャ魂！
- エピソード 33 : ルーシー改造計画
- エピソード 34 : サバイバルバトル決勝戦！
- エピソード 35 : 決定！ニンジャラマスター！
- エピソード 36 : ビーチでニンジャが休息
- エピソード 37 : オエドタウン・ぶらり旅
- エピソード 38 : 恐怖！アカデミーの夜
- エピソード 39 : オイラは剣士カッペイ
- エピソード 40 : やれいけ！パンプキン大魔王
- エピソード 41 : 振り向けばロンがいる
- エピソード 42 : 清き一票！仁義なき選挙戦
- エピソード 43 : 追放!?ＷＮＡアカデミー
- エピソード 44 : うんち諸君！
- エピソード 45 : 風雲‼アジト攻略戦
- エピソード 46 : イーグルシティの新英雄（ニューヒーロー）（１）
- エピソード 47 : イーグルシティの新英雄（ニューヒーロー）（２）
- エピソード 48 : 執念の暗殺者
- エピソード 49 : 隕石大争奪バトル！
- エピソード 50 : シャドーニンジャの逆襲
- エピソード 51 : オペラ座の決戦！
- エピソード 52 : 究極奥義・無明闇分身
- エピソード 53 : ＷＮＡ解体命令!?
- エピソード 54 : 断崖（がけ）の上のルーシー
- エピソード 55 : 我が名はマスターシャドー
- エピソード 56 : ギブミー！ニンジャガム！
- エピソード 57 : アカデミー攻防戦！
- エピソード 58 : イーグルシティ独立宣言
- エピソード 59 : 決闘！バートンVSダン
- エピソード 60 : 衝撃！仮面の下の真実
- エピソード 61 : 急襲！ボトルコレクターズ
- エピソード 62 : WNA！史上最大の忍務！
- エピソード 63 : 鬼神招来！目覚めよバートン
- エピソード 64 : イーグルシティの来訪者
- エピソード 65 : どーするオレ⁉どーするエゼット！
- エピソード 66 : 開幕！ニンジャラBF（バトルフェスティバル）
- エピソード 67 : 参上！怪盗エゼット
- エピソード 68 : バーンのリーダーはつらいよ
- エピソード 69 : 狙われたロン
- エピソード 70 : ベレッカのオモテナシ
- エピソード 71 : 宇宙から来た二人組
- エピソード 72 : 仲間を信じて勝利をつかめ！
- エピソード 73 : エゼットの使命
- エピソード 74 : さらわれたベレッカ！
- エピソード 75 : ようこそ！WNAアカデミー
- エピソード 76 : 宇宙船復活大作戦
- エピソード 77 : 宇宙を目指してフィッシング！
- エピソード 78 : 11人…いる!?
- エピソード 79 : 猫とカラスと源柳斎と
- エピソード 80 : フンドルケットル危機一髪
- エピソード 81 : はるばる来たぜメルウス星
- エピソード 82 : 初忍務はグルメ偵察
- エピソード 83 : オアシスを奪還せよ
- エピソード 84 : 遺跡の秘密は夜ひらく
- エピソード 85 : 激闘！目指せ大聖堂
- エピソード 86 : 襲撃！ガムゴゼン
- エピソード 87 : メルウス星を取り戻せ！
- エピソード 88 : 仁義なき選挙戦 パート２
- エピソード 89 : 無人島でトレジャーハント
- エピソード 90 : ニンジャちがって、ニンジャいい
- エピソード 91 : 走れカッペイ！消えた源雲斎
- エピソード 92 : ルーシーと熊ちゃんギャング団
- エピソード 93 : 女スパイ ジェーンの秘密
- エピソード 94 : ガムッチとの遭遇
- エピソード 95 : ウォーレンの憂鬱
- エピソード 96 : 発明家バートン
- エピソード 97 : 風林火山！アカデミー大運動会
- エピソード 98 : 名探偵ベレッカの事件簿
- エピソード 99 : さよなら？デイジー先生
- エピソード 100 : カッペイ、ワニを届ける
- エピソード 101 : 第101話
- エピソード 102 : 第102話
- エピソード 103 : 第103話
- エピソード 104 : 第104話
- エピソード 105 : 第105話
- エピソード 106 : 第106話
- エピソード 107 : 第107話
- エピソード 108 : 第108話
- エピソード 109 : 第109話
- エピソード 110 : 第110話
- エピソード 111 : 第111話
- エピソード 112 : 第112話
- エピソード 113 : 第113話
- エピソード 114 : 第114話
- エピソード 115 : 第115話
- エピソード 116 : 第116話
- エピソード 117 : 第117話
- エピソード 118 : 第118話
- エピソード 119 : 第119話
- エピソード 120 : 第120話
- エピソード 121 : 第121話
- エピソード 122 : 第122話
- エピソード 123 : 第123話
- エピソード 124 : 第124話
- エピソード 125 : 第125話
- エピソード 126 : 第126話
- エピソード 127 : 第127話
- エピソード 128 : 第128話
- エピソード 129 : 第129話
- エピソード 130 : 第130話
- エピソード 131 : 第131話
- エピソード 132 : 第132話
ニンジャラ
